⟪數位醫療 AI⟫ 加州大學的新型演算法「DORGE」，協助發掘未知的癌症相關基因
細胞的癌化，有時是因為基因「序列」突變，有時，則是因為基因「表現」異常所導致；一旦細胞分裂與細胞凋亡之間的平衡遭到破壞，就會形成腫瘤細胞。為了更加了解腫瘤發生中的表觀遺傳機制，並尋找以往未發現的癌症相關基因，加利福尼亞大學爾灣分校的研究人員，利用稱為「DORGE」 (利用遺傳和表觀遺傳學特徵發現癌基因和腫瘤抑制基因) 的新型演算法，整合目前最完整的遺傳學與表觀遺傳學數據，以此鑑定出新的腫瘤抑制基因 (tumor suppressor gene, TSG) 以及致癌基因 (oncogene, OG)。
透過 DORGE 演算法發現，「組蛋白修飾」 (histone modification) 是 TSG 的強預測因子，而錯義突變 (missense mutation)、超級增強子 (super enhancer) 和甲基化差異 (methylation difference)，則是 OG 的強預測因子。此外，被 DORGE 演算法同時預測為 TSG 和 OG 的「雙重功能基因」，有許多都集中在「蛋白質-蛋白質交互作用」和「藥物-基因網絡」中的樞紐位置上。
新的演算法所帶來的新發現，將可能有助於未來對於癌症的預防、診斷和治療工作。
資料來源：Medical Xpress、加州大學爾灣分校
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