《基因編輯》MIT: 大片段 DNA 嵌合技術「PASTE」,具潛力治療基因缺陷多種疾病

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麻省理工學院 (MIT) 研究員 Omar Abudayyeh、Jonathan Gootenberg 的研究團隊 11 月 24 日於《Nature Biotechnology》上的一篇論文中,詳細介紹了他們稱之為「PASTE」(Programmable Addition via Site-specific Targeting Elements) 的 DNA 嵌合技術,認為其有潛力可被用來插入長片段的 DNA、治療由許多不同突變引起的遺傳疾病,如囊腫性纖維化 (cystic fibrosis) 和萊伯氏先天性黑朦症 (Leber Congenital Amaurosis, LCA)。該技術目前已被授權給兩人於 2021 年 2 月成立的公司 Tome Biosciences。

原理
研究人員表示,「PASTE」融合了兩種現有技術:一為「prime editor」(由 Broad 公司的 David Liu 首創,後來其專利分拆至新創公司 Prime Medicine),另一為「嵌入酶」(integrase,由病毒產生的酵素,可將病毒遺傳物質嵌入宿主細胞基因體中)。

「嵌入酶」可以攜帶大片段 DNA,不過,它只能辨識、作用於特定目標序列,因此無法隨意嵌入我們想要的位置;而「prime editor」,雖然僅能攜帶很短的片段 (例如「嵌入酶」的目標序列),但卻可應用於「瞄準並編輯特定位置」。因此,結合兩者,研究人員就可以在想要的位置上插入長達 36,000 個鹼基對的序列。在該論文中,研究人員已在多種人類細胞 (肝細胞、T 細胞和淋巴母細胞) 中、以 13 種不同基因 (包括一些可能具有治療作用的基因) 測試了此遞送系統,並能夠將這些基因插入基因組的九個不同位置,成功率 5%~60%。

特點
研究員 Omar Abudayyeh 表示,與目前的基因編輯方法不同的是,「PASTE」可透過替換整個基因來同時解決許多突變;此外,該技術不會在 DNA 中產生雙鏈斷裂,減少了不必要的 DNA 插入或刪除的風險。

相似技術
2021 年 12 月,同樣是在《Nature Biotechnology》期刊上,上方提及的 David Liu 的團隊描述了一種相似的方法,唯一不同的是,Liu 的團隊是讓「prime editor」和「嵌入酶」分別作用。至於兩個團隊的技術,有無實質差異、效率孰高孰低,則各方有其不同看法。

值得注意的是,「PASTE」技術中雖然使用了「prime editor」,但 Tome Biosciences 並沒有與 Prime Medicine 簽訂許可文件,也沒進行任何談判。

另外,此類技術目前仍處於「將技術轉化為商業療法」的早期階段,也從未在人類身上使用過。在 MIT 的 Abudayyeh 和 Gootenberg 的論文中,在具有「人源化肝臟」的小鼠體內 (其肝臟約有 70% 是人類肝細胞),「PASTE」技術成功地將新基因整合到大約 2.5% 的肝臟細胞中;對此,其他科學家認為至少要達到 10% 左右才能有一些治療效果,因此還有很大的改進空間。Tome Biosciences 則表示,希望能在 2026 年之前進入臨床試驗階段。

資料來源:Endpoints News、MIT

 

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